Dodatkowo, pula ta zostanie obciążona kosztami działań z zakresu oceny wniosków aplikacyjnych, monitoringu i ewaluacji ex-post, które będą przeprowadzane przez instytucje państw-darczyńców.
Przyznana Polsce kwota w wysokości 533,51 mln euro będzie wykorzystywana w latach 2004-2009, przy czym ostatni nabór wniosków aplikacyjnych zostanie ogłoszony w 2008 roku. Jednocześnie trzy kraje EFTA należące do EOG wprowadziły pewne ograniczenia w dostępie do swoich rynków pracy dla pracowników z nowych państw członkowskich UE (Islandia, Lichtenstein - dwuletni okres ograniczenia dostępu do rynku pracy, Norwegia - utrzymany został wymóg uzyskiwania zezwolenia, udzielając pozwoleń na pracę nie wymaga wykazania przez pracodawcę braku kandydatów na wewnętrznym rynku pracy).
We wdrażanie mechanizmów finansowych zaangażowane są zarówno instytucje państw-beneficjentów, jak i państw-darczyńców. Po stronie państw-beneficjentów ogólna odpowiedzialność za wdrażanie środków spoczywa na Krajowym Punkcie Kontaktowym, którego funkcję w Polsce sprawuje Ministerstwo Gospodarki i Pracy. Po stronie państw-darczyńców Mechanizmem Finansowym EOG zarządza Komitet Mechanizmu Finansowego EOG, zaś Norweskim Mechanizmem Finansowym - Norweskie Ministerstwo Spraw Zagranicznych. Za zarządzanie mechanizmami w sensie operacyjnym (m.in. za kontakty z Krajowym Punktem Kontaktowym) odpowiedzialne jest Biuro Mechanizmów Finansowych (BMF) w Brukseli.  
Strona polska będzie kierować do oceny przez instytucje państw-darczyńców tylko te projekty, które pozytywnie przejdą procedurę selekcji w kraju. Jednak ostateczną decyzję o przyznaniu dofinansowania oraz jego wysokości podejmują instytucje państw-darczyńców. Maksymalne dofinansowanie projektów z mechanizmów finansowych waha się od 90% do 60% całkowitych kosztów kwalifikowalnych. Poziom dofinansowania uzależniony jest od sposobu finansowania projektu, tj. czy będzie on finansowany z obu Mechanizmów czy tylko z jednego. Ponadto, w przypadku organizacji pozarządowych możliwe jest dofinansowanie w wysokości 90% kosztów kwalifikowanych.