Warto podkreślić, iż każda organizacja posiadająca system zarządzania bezpieczeństwem i higieną pracy powinna prowadzić wewnętrzne audyty bhp. Przeprowadzanie okresowych audytów wiąże się z koniecznością ustanowienia i utrzymywania udokumentowanej procedury oraz programu prowadzenia audytów, obejmującego ustalenia dotyczące kompetencji audytorów, zakresu audytów, ich częstotliwości, metodologii i dokumentowania wyników. Celem audytów wewnętrznych jest stwierdzenie, czy system zarządzania bhp został skutecznie wdrożony. Bowiem tylko system skutecznie wdrożony zapewnia spełnienie norm wymagań i przepisów prawnych i co najważniejsze gwarantuje bezpieczeństwo pracy zatrudnionych w organizacji pracowników.

Już na wstępie nie sposób pominąć kwestii związanych z kompetencjami osób, przeprowadzających audyty wewnętrzne. Warto zaznaczyć, że mogą to być zarówno osoby zewnętrzne, jak i pracujące w danym przedsiębiorstwie. Osoby te powinny być jednak niezależne w stosunku do audytowanych działań.

Każdy audyt powinien być przeprowadzany według ustalonego programu, obejmującego okres pozwalający na ocenę wszystkich elementów systemu zarządzania bhp, zgodnie z ustalonymi procedurami. W wyniku przeprowadzenia audytu powstaje dokumentacja poaudytowa, w której zawarte są ustalenia z audytu dotyczące funkcjonowania systemu, wykrytych niezgodności czy miejsc do doskonalenia. Raport z audytu powinien być przedstawiony przedstawicielowi najwyższego kierownictwa ds. systemu zarządzania bezpieczeństwem i higieną pracy. To właśnie na jego podstawie powinny zostać podjęte odpowiednie działania korygujące i zapobiegawcze.

Ogólna zasada prowadzenia audytów wewnętrznych bhp jest podobna do zasady prowadzenia audytów jakości. Warto przypomnieć, że ogólnie audyty bezpieczeństwa pracy można podzielić na audyt systemowy, który ocenia przede wszystkim dokumentację systemu zarządzania bhp i jego funkcjonowanie oraz audyt stanowiskowy, który ocenia warunki pracy na konkretnym stanowisku lub wykonywania konkretnej pracy. Warto dodać, że w celu prowadzenia audytów systemowych można opracować kryteria oceny poszczególnych elementów systemu zarządzania bhp.

Wynikiem przeprowadzonych audytów powinny być odpowiednie działania korygujące i działania zapobiegawcze. Celem realizowanych działań korygujących ma być identyfikacja i eliminacja przyczyn niezgodności wykrytych podczas audytu, podczas gdy działania zapobiegawcze odnoszą się do niezgodności, którym przez realizację tych działań nie dajemy szansy na pojawienie się. Każde działanie korygujące i zapobiegawcze podjęte w celu wyeliminowania przyczyn stwierdzonych lub potencjalnych niezgodności powinno być odpowiednie do związanych z nim zagrożeń i ryzyka zawodowego.  

Certyfikacja systemu zarządzania bhp realizowana na zgodność systemu z normą PN-N 18001 może mieć miejsce dopiero po jego wdrożeniu i przy utrzymywaniu dowodów tego wdrożenia w postaci dokumentów i zapisów. Certyfikację, podobnie jak w przypadku systemów zarządzania jakością czy zarządzania środowiskowego, przeprowadzają uprawnione do tego jednostki certyfikacyjne. Wydelegowani audytorzy oceniają funkcjonowanie systemu i spełnienie wymagań normy przez ocenę przyjętych rozwiązań, ich realizacji oraz skuteczność.