Zgodnie z ustawą o podatku od towarów i usług z dnia 11 marca 2004 r (Dz. U. nr 54, poz. 535; ostat. zm. w Dz. U. z 2006 r. nr 143, poz. 1028 i 1029) w art. 86 ust. 12 ustawodawca zawarł zastrzeżenie, zgodnie z którym w przypadku otrzymania faktury przed nabyciem prawa do rozporządzania towarem, prawo do odliczenia VAT powstaje z chwilą nabycia tego prawa. Sytuacja taka ma miejsce wtedy, gdy wystawiono fakturę VAT, a dostawa towaru nie miała jeszcze miejsca. Jeśli więc podatnik otrzyma zakupiony towar, którym może rozporządzać, ewentualne zastrzeżenie zawarte w fakturze na temat tego, że towar pozostaje własnością sprzedawcy do chwili zapłaty, nie stanowi problemu w uznaniu, że miała miejsce dostawa oraz w skorzystaniu z prawa do odliczenia podatku naliczonego przez nabywcę.

Zastrzeżenie, o którym mowa powyżej, dotyczy również nabywanych usług. Otrzymanie faktury przed wykonaniem usługi powoduje, iż prawo do odliczenia VAT powstaje z chwilą wykonania tejże usługi. Zasada ta jednakże nie dotyczy czynności, dla których obowiązek podatkowy powstał w sposób szczególny, czyli nabycia np. mediów, usług budowlanych, spedycyjnych czy transportowych. Zatem z jednej strony podatnik świadczący takie usługi wykazuje obowiązek podatkowy w szczególnym momencie, z drugiej natomiast nabywca tych usług ma prawo do odliczenia VAT-u na zasadach ogólnych, bez względu na to czy usługa została wykonana, czy też nie.

Przy odliczaniu podatku należy wspomnieć również, iż szczególny sposób rozliczania podatku naliczonego dotyczy zarówno wewnątrzwspólnotowego nabycia towarów, jak i importu usług. Chodzi mianowicie o to, że podatnik dokonujący importu usługi lub wewnątrzwspólnotowego nabycia towarów zobowiązany jest do naliczenia podatku VAT, związanego z tymi czynnościami. W deklaracji VAT-7 podatnik z jednej strony nalicza podatek należny, a z drugiej odlicza naliczony z tytułu ww. czynności. Przeważnie podatek ten podlega odliczeniu w rozliczeniu za okres, w którym powstał obowiązek podatkowy.